3、EC001 - 013 原罪和第七 ...
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EC001 (Original Sin)
Meta看见在管子里自己的双子，Meta恢复了记忆知道自己是Seth的人造人，不想让她的孩子也成为Seth的玩具，Meta带着双子在Pale的帮助下跑了，Pale被Seth抓住，刷新成为了Kiril Clockworker。
（对应歌曲：Escape of Witch Salmhofer）
Meta逃到了邻国Elphegort，在Held forest里Meta留下双子自己去找吃的，回来时双子被住在这个森林里的Eve发现抱走了，Meta一直追一直追。Eve抱着双子回到了她和Adam的家，Adam看到后很惊讶，他想让Eve还回去但Eve没在听，Adam发现家门口的尸体是Meta，她的篮子里有两个装了牛奶的玻璃小瓶，瓶子上写着Gretel和Hansel，并在Eve的袖口里发现了蓝色勺子，不知道是有意还是无意，Eve用蓝色勺子发动了雷电杀死了杀父仇人Meta。Adam不希望有人发现，他把Meta在后院埋了，本来想把双子也给杀了的但没能下手，决定和Eve一起抚养。
（对应歌曲：Moonlit Bear）
因为Eve是在日历EC001年犯罪的，所以她被称为是原罪者。
之后又经历了多次Project Ma，但都没有成功，要么人选被Apocalypse的成员给杀了，要么只着床了一个被惩罚了，其中有位成功怀了两个的人选被自己的丈夫给杀了，他的尸体在Nemu村被发现，发现时肚子里的孩子已经消失了。传言是他的丈夫挖走了，那对双子随后成为了Lucifenian皇室的祖先。
EC013 (7th Project MA)
第七届Project Ma开始了。Kiril Clockworker的未婚妻Elluka Chirclatia 和妹妹Irina Clockworker （Irina也是Seth制造的人造人，用的是Maria/Alice的基因）。
Elluka拥有治愈HERs的能力，她治好了Kiril. Irina也有HERs，但她隐瞒了。这次人选有四人，能成为女王诞生双子的只有其中一人，Seth劝诱Irina杀死三人，这样她就能成为新的女王。Irina照做了，最后杀的是嫂子Elluka。Irina成为了新的女王。
（对应歌曲：MA Survival - Who Will Survive）
Kiril很伤心，自己的妹妹杀了自己的未婚妻，他想要报仇准备杀了Irina。但此时她听见了Elluka的声音，说只要把她的身体放进Ark Sin里她就能复活。
（对应歌曲：Whereabouts of the Miracle - Catarophe)
其实这个声音是Levia伪装的，Levia和Behemo已经等不及了，他们打算用Elluka的身体来复活。Kiril相信了这个声音，把Elluka放进了Ark Sin然后启动了。Levia和Behemo的灵魂进入了Elluka的身体，但启动时同时唤醒了双头龙，双头龙身体里没有灵魂开始乱动，引发了大爆炸，神圣Levianta王国基本给炸没了。
因为爆炸的影响，在Elluka体内的Levia产生了混乱，读取了Elluka的记忆，Levia以为自己就是Elluka。她在爆炸中毫发无伤，并命名自己为Elluka Clockwoker。此时Behemos虽然也在Elluka的身体里，但他看见Levia占了主权，他选择沉睡。
大爆炸中Seth半死不活的找到了同样半死不活的Irina，他扔给Irina一个自己制造的体内有Blackbox红色猫的玩偶，把Irina的灵魂附生在了红色猫里，让Irina继承他的实验继续散播恶意，随后Seth死了。
（对应歌曲：The Song I Heard Somewhere）
因为这次大爆炸，所有来自第二世界的‘遗产’都被销毁了。同样因为大爆炸，Seth的恶意种子也被销毁了，制造不出来有HERs的人造人了，但销毁后仍然有些在空气里，人类有几率生出天生的HER。
作者有话说
第3章 EC001 - 013
