1、原著时间线 ...
-
1999年
——碇唯提出形上生物学突破性理论，被冬月采用，并成为冬月的爱生。
——冬月保释出喝酒闹市进警局的六分仪原堂，唯与源渡交往。
2000年
……8月15日
——南极的葛城调查队众博士提出S2机关理论，并要在九月十三日做亚当融合实验。
……9月13日
——实验出乎意料，亚当力量觉醒，南极大陆大爆炸，全世界发生第二次冲击。唯一生还者---葛城美理。
——源渡和唯一同加入SEELE。
——碇唯和源渡结婚，源渡改姓氏为碇。（原姓六分仪）
2001年
——碇真嗣诞生
——铃原冬二诞生
——明日香、渚薰、相田剑介诞生
2002年
——冬月正调查第二次冲击的真相，并发现光之巨人的疑点，及对当时关于冲击的新闻表示经过幕后操纵。
——患上失语症的小美理，被安排在南极调查船的第1隔离室内静养。
2003年
——人工进化研究所设立
——冬月指责源渡隐瞒二次冲击的真相，并要求对外公报。
——源渡带冬月往地下都市。E计划确定存在。零号机雏型登场。
——冬月加入SEELE的组织，与源渡同一计划。
——研究室内，赤木博士母女登场。
2004年
……11月
——箱根的地底第二实验场，进行着EVA接触实验，实验失败，唯消失。
——唯死后一周，亚当计划和人类补完计划开始。
——小真嗣登场
2005年
——第二迁都计划，第三新东京市兴建计划展开。
——第二东京大学，律子认识了美里，美里与加持交往。
——凌波丽（壹）诞生。
2008年
——MAGI基础理论完成。
——律子进入GEHIRN，美理也进入GEHIRN德国分部。律子看见母亲直子和源渡私通。
——明日香成为第二适任者，明日香正想把此消息告知其母亲京子，房间内上吊的京子摇晃着。
2010年
——天顶都市初步完成。
——直子向律子表示MAGI是三个自己。
——直子掐死凌波丽（壹）。
——直子自杀。
——GEHIRN改名特务机关NERV。
2014年
——凌波丽（贰）被选为第一适任者，居往第三新东京市。进入市立第一中学就读。
——明日香大学毕业。
——EVA零号机、初号机、贰号机建造完成。
2015年【故事主线从这里开始】
……6月
——某日零号机进行连动实验失控，零身受重伤。
——下午十二时三十分，第三使徒来袭，真嗣的初号机暴走将使徒滥打，最后使徒与初号机自爆但没有将初号机炸掉。
——美理正式成为真嗣的监护人，并且将真嗣接到家中同住，自此时起真嗣转入市立第一中学就读。
……7月
——上旬，第四使徒来袭，被初号机歼灭。
——真嗣离家出走，及后被谍报部寻回。
……8月
——月初某日上午九时左右，NERV研究第四使徒，但结果亦没有公布。
——某日下午二时左右零号机进行第三次连动实验，实验成功。第五使徒来袭，隔日被初号机用阳电子炮并重核心毙命。
——某周三，JetAlone完成发表纪念会。
——28日太平洋舰队运载贰号机与亚当至日本，下午第六使徒来袭，被下沈的两艘战舰零距离攻击使徒歼灭。
——隔日明日香转入市立第一中学二年A班就读。
……9月
——5日上午10时33分，第七使徒来袭，开始被贰号机一棍切离，使徒居然一分为二。10时58分两机被使徒整成惨状。
——上午11时5分联合国空军利用N2地雷炸毁使徒甲表面物质约28%及使徒乙表面物质约27%。
——隔日，明日香搬进美里家与真嗣进行配合特训。
——11日上午初、贰两机同时重击使徒两个核心，消灭使徒。
——下旬，NERV在浅间火山口发现第八使徒，原想捕捉样本，但使徒在捕捉过程孵化，由D型装备贰号机歼灭。
……10月
——月初某周五，上午10时30分，零号机改，进行第二次延长活动实验，机体亦复修完毕，涂装改为蓝色。
——月初某周五，NERV本部大停电，第九使徒在旧热海登陆，三部EVA首次同时出动，并于同日击灭使徒。
——中旬，源渡和冬月自南极运送罗基奴斯长枪回本部。第十使徒在卫星轨道出现，以带AT力场的分体进行攻击，美里打算利用三架EVA直接阻止使徒下降，翌日作战成功，使徒消灭。
……11月
——上旬某日约上午11时，三位适任者进行直接以身体同步实验，途中MAGI被十一使徒入侵，并执行自爆系统，下午1时左右律子从CASPER传送自灭促进程式，消灭使徒。源渡对SEELE否认有入侵的事件。
——上旬某日，真嗣进行第一次机体互乘实验，结果失控。真嗣则于同日恢复意识。
——某周日，唯之忌日，真嗣与源渡到坟前拜祭。深夜，明日香与真嗣接吻；街上，美里与加持相吻定情。
——翌日，零在本部深度地底设备中央部试验DUMMYSystem。地深两千八百公尺。最终教义区，加持被美理洞悉了真正身份，加持将天堂之门打开，看见巨人亚当，实际上是LILITH。
——月底，真嗣的同步率终于超越明日香，令明日香大怒。
……12月
——月初，第十二使徒来袭，初号机被使徒的迪拉克之海吞没，翌日清晨初号机在没有供电力情况下再起动，出现暴走状态，消灭十二使徒。
——上旬，第三新东京市伪装迎击系统完成。早上，北美第二支部消失，连带EVA肆号机、S2机关及半径四十九公里的研究设施全部消灭，据知当时在进行S2机关的实验。
——DUMMYPlug试作型开发完成。下午确认第四适格者为铃原冬二。参号机运送至日本本部，其已被使徒寄生，参号机起动实验发生事故，被作成十三使徒处理，初号机初次使用DUMMYSystem，将使徒肢解。真嗣知道第四适格者是冬二，大怒要破坏NERV，后因被提高LCL浓度而昏迷，真嗣被拖出驾驶舱。
——三天后，失去左脚的冬二恢复意识。真嗣离开NERV，适格者资格取消。十四使徒来袭，直接攻进GEO-FRONT。贰号机的双臂和头被刺飞，零驾驶零号机抱着N2爆雷自杀式攻击无效，脸被切半。使徒将NERV本部滥炸入侵主轴往中央教条区前进发令所。真嗣回来驾驶初号机把使徒推出本部，初号机活动极限，使徒反击，初号机暴走攻击并吃掉使徒，将S2机关据为己有。真嗣与初号机同步率400%，完全融于LCL中，隔日救援真嗣行动展开，事后二十七日救回真嗣。不久，源渡将亚当植入右手。
——三日后，加持将内藏第二次冲击的秘密胶囊交给美里。
2016年
……1月
——下旬，冬月在地下都市西区第八区失去消息，其被抓去SEELE审问，冬月被加持救回，下午，加持被枪杀身亡，凶手可能为同为政府监察部的中年女子。谍报部认为加持是事件主谋者，美理受到侦讯。
……2月
——上旬，第十五使徒来袭，后来零号机以罗基奴斯长枪消灭目标。
——中旬，十六使徒来袭，零号机自爆与使徒同归于尽，零的遗体在插入栓中发现,律子命秘密处理,但零毫发无伤，其实已经是第三个零了。
——几天后，美理解开胶囊，决心继承加持的心意，追查补完真相。律子破坏DUMMYSystem。
——下旬，明日香失踪。七日后，被谍报部二课寻回。
——第五适格者．渚薰抵达NERV，真嗣对薰产生好感。同日，同步测试中，薰可以和未改写核心的贰号机同步，令众人惊讶。翌日，美理知道薰能自由设定与EVA的同步率。途中薰同化贰号机，展开超强大AT力场，形成结界，掩盖所有探测。零亦展开同等力量的AT力场，中和结界。
——最后使徒————熏，直接闯进中央教条区，并将最后防卫线．天国之门开启，但渚薰自愿被初号机杀害。
……3月
——上旬，某日上午5时59分，美理终于知道第2次冲击的秘密。
——律子对MAGI加上666号防壁，SEELE下令直接强行占据NERV本部设施。上午6时正，5国支部MAGI同时入侵NERV本部，目标在夺取MAGI主系统。
——同日，SEELE颁报A-801训令，取消NERV本部所有特权。战自大队入侵，源渡宣报全员进入第一战斗态势。第三新东京市遭到N2爆雷疯狂轰炸，连同天井都市消失。7时23分23秒，于46通道发现真嗣。美理出发救援。明日香被运往贰号机，发射上70米深的湖底。成功救回真嗣，并带真嗣往初号机而去。
——明日香觉醒，向战自大队反击。美理在第6紧急电梯入口被枪击受伤。美理对真嗣献出最后一吻，之后真嗣乘电梯到第7收容处。约2分钟后，律子意图执行自爆系统，但失败。2分钟后，贰号机大战EVA量产机。美理被炸死亡，享年29岁。律子被源渡枪杀身亡，享年31岁。源渡意图令ADAM与LILITH融合。
——贰号机击败EVA量产机，电源用尽，但被无故飞来的复制朗基奴斯之枪插中头部，明日香惨叫。贰号机暴走，但再被9枝复制朗基奴斯之枪射中。EVA量产机再起动，并将贰号机肢解。
——初号机自行启动，欲真嗣乘坐其中。朗基奴斯之枪从大气层飞回初号机前。SEELE所谓的“仪式”开始进行。EVA量产机在初号机身上刻上圣痕。EVA量产机与初号机形成了生命之树。S2机关解放，释放高能量爆炸，战自大队全灭。
——地下都市回归真实面貌，LILITH之卵，黑之月。
——18使徒出现。零背叛源渡，自行和LILITH融合，源渡失去右手。
——EVA量产机与零同化。真嗣心理图混乱。初号机与朗基奴斯之枪同化，形成生命之树。反AT力场增大，生物已无法保持形态。
——补完计划最后阶段。灵魂之屋开启，全人类形体化成LCL。真嗣放弃补完计划，走出第十八使徒。最后，地球出现生命之海。只剩下真嗣和明日香存活于世。
作者有话说
第1章 原著时间线
